ظفرقندی، فعالیت رسمی خود را در وزارت بهداشت آغاز کرد.
وزیر بهداشت یکم شهریور ماه در نخستین اقدام با حضور در دانشکده پرستاری در جریان برگزاری آزمون دانشنامه تخصصی و سی و هشتمین دوره آزمون گواهینامه - دانشنامه فوق تخصصی پزشکی قرار گرفت.
وی همچنین شامگاه همین روز در آیین گرامیداشت روز پزشک که با حضور رئیس جمهور برگزار شد، حضور یافت و سپس از کار درمان بیمارستان سینا که مدتی ریاست آن را نیز بر عهده داشت، قدردانی کرد.
وزیر بهداشت یکم شهریور از طرح مشکلات مطالبات پرستاران در جلسه روز گذشته هیات دولت خبر داد و گفت: با دستور و پیگیری دکتر پزشکیان، مطالبات دانشگاههای علوم پزشکی و بیمهها در اسرع وقت پرداخت و مشکل انباشت مطالبات جامعه پرستاری ظرف دو هفته آینده برطرف می شود.
ظفرقندی با اشاره به کمبود بیش از ۳۰۰ قلم دارو و برنامه دولت برای رفع آن، خاطر نشان کرد: برای حل مشکلات دارو و به حداقل رساندن کمبودهای دارویی، جلسات کارشناسی زیادی با رئیس جمهور و معاون اول داشتیم و از سوی دیگر با موافقت رهبر معظم انقلاب برای حل این مشکلات، بخشی از منابع مورد نیاز از صندوق ذخیره ارزی تامین خواهد شد.